Rabu, 15 Januari 2014

TUTORIAL SOFTWARE SIMFIT

Langkah 1 - instalasi WINE Install WINE , saran yang untuk men-download dan menginstal tonggak terbaru ( rpm dikemas ) dari winehq.com menggunakan yast2 . Ini akan membuat instalasi Windows virtual yang akan membuat rumah instalasi SIMFIT Anda . WINE akan membuat direktori di folder rumah Anda disebut anggur yang berisi folder drive_c . . Folder drive_c ini ditiru sebagai Windows C : \ drive di dalam program Windows tergantung seperti SIMFIT . Direktori home Linux Anda ditiru sebagai Y : \ .
Langkah 2 - Software Download Download installer SIMFIT dari situs download SIMFIT .
Langkah 3 - Instalasi Jangan mencoba untuk menginstal Ghostscript atau GSview , seperti Ghostscript , PS - pemirsa dan pembaca PDF - yang dibangun ke Linux . Untuk menginstal SIMFIT , pertama unzip file simfit_install.zip ( saya menggunakan Ark untuk ini karena saya menggunakan KDE ) dan pastikan untuk membaca file linux.txt . Anda dapat menginstal dengan mengklik file simfit_setup.exe dibuat .
Langkah 4 - Konfigurasi
    ( 1 ) Membaca file teks dikemas dengan program instalasi , terutama linux.txt ,  yang berisi banyak informasi yang berguna . Jika ini adalah instalasi pertama  kali , Anda harus menghapus file l_simfit.cfg dan w_simfit.cfg dari folder  SIMFIT , untuk memberikan SIMFIT kesempatan untuk membuat konfigurasi  Linux . Jika default konfigurasi Windows dapat diinstal . Perhatikan bahwa  SIMFIT tidak menimpa file-file konfigurasi pada instalasi . Juga , Anda dapat  menghapus file konfigurasi , seperti w_simfit.cfg dan l_simfit.cfg setiap saat  dan SIMFIT akan menciptakan default yang sesuai .

( 2 ) Pertama kali Anda memulai SIMFIT Anda dipenuhi oleh layar permintaan  yang bertanya tentang l_simfit.cfg berkas , yang merupakan penyimpanan  untuk semua konfigurasi SIMFIT - pengguna tertentu . Bacalah teks dalam  hal ini dan dialog permintaan berikutnya dengan hati-hati , karena pilihan  yang salah akan mengharuskan Anda memperbaiki konfigurasi setelah itu  ( bukan masalah besar , tapi kerumitan yang tidak perlu ) .

( 3 ) Beberapa pertanyaan tentang huruf drive , saya menggunakan Z untuk root
        ( / ) partisi dan Y untuk direktori rumah saya ( / home / Micke ) .

( 4 ) Beberapa pertanyaan tentang nama-nama direktori instalasi , anggur - install  dir adalah sama dengan direktori home Anda .

( 5 ) Anda kemudian disajikan dengan saran untuk konfigurasi . Di sini Anda  dapat mengubah kesalahan yang jelas dalam konfigurasi sebelumnya , seperti  jalur direktori dan semacamnya . Juga memeriksa saran SIMFIT untuk  program tambahan ( editor , kalkulator dan semacamnya ) . Alter sesuai  dengan preferensi pribadi Anda . Saya adalah pengguna KDE sendiri dan  karena itu lebih memilih aplikasi KDE .

( 6 ) SIMFIT sekarang menulis file konfigurasi .langkah 4 - Konfigurasi( 1 ) Membaca

( 7 ) Proses instalasi harus  menyediakan Anda dengan sebuah entri di menu  K ( Wine > Programs > Simfit > Simfit ) . Mengklik ikon Simfit harus  menjalankan program up . Mengklik tombol Configure di bagian bawah  jendela utama meluncurkan konfigurasi saat ini . Dalam jendela ini adalah  mungkin untuk mengubah salah satu parameter configurated . Setelah  perubahan , tekan Periksa untuk menguji bahwa nilai yang dimasukkan  valid , kemudian simpan dengan menekan Apply .Di bawah ini adalah  screenshot dari konfigurasi SIMFIT saya. Ini menggunakan alat kwrite KDE  ( editor teks ) kprint ( untuk pencetakan ) , kcalc ( kalkulator ), dll  conf  simfit . pengaturan 

Langkah 5 - Fit data Anda Dengan prosedur yang diuraikan Saya telah menjalankan SIMFIT stabil di bawah SUSE , dan kemudian openSUSE Linux , selama bertahun-tahun , sehingga tidak ada alasan untuk boot ke Windows hanya untuk dapat memanfaatkan paket program benar-benar hebat ini .Tanggapan saya tidak akan menanggapi setiap pertanyaan tentang program SIMFIT - mereka harus diarahkan ke Bill . Jika Anda memiliki beberapa pertanyaan umum tentang menjalankan SIMFIT dalam openSUSE Anda bisa menghubungi saya mikael.widersten @ biorg.uu.se , tapi aku tidak bisa menjamin respon apa yang pernah jadi .

ChemSense

ChemSense merupakan aplikasi yang memungkinkan Anda untuk membuat dan berbagi teks, gambar, grafik, serta animasi dari sebuah proses kimia. Software ini dikembangkan oleh SRI International, dengan bantuan dana dari National Sciense Foundation mulai tahun 1998-2004, dan dirilis sebagai open source pada tahun 2007.

Berikut ini adalah tampilan dari ChemSense:

ADMET Predictor


ADMET Predictor merupakan sebuah software yang dapat memprediksi sifat ADMET. ADMET adalah singkatan yang pada umumnya digunakan dalam farmasi industri untuk menunjukkan fenomena yang erat kaitannya dengan Absorpsi, Distribusi, Metabolisme, Eliminasi dan Toksisitas zat kimia dalam tubuh manusia. ADMET Predictor tidak hanya cepat memperkirakan sejumlah sifat vital ADMET dari struktur molekul , tetapi juga mampu membangun model prediksi sifat baru dari data pengguna melalui modul terintegrasi ADMET Modeler.

Keunggulan dari ADMET Prediktor
1. AKURASI: model prediksi yang telah secara konsisten dinilai sebagai yang paling akurat dengan
    perbandingan pihak ketiga yang independen - Lihat lebih lanjut di: http://www.simulations
    plus.com/Products.aspx?pID=13 # sthash.JTLyDqHj.dpuf

2. KECEPATAN: dapat memproses sampai dengan 200.000 ~ senyawa per jam pada PC notebook.
   -Lihat lebih lanjut di: http://www.simulations-plus.com/Products.aspx?pID=13 #
     sthash.JTLyDqHj.dpuf

3. KENYAMANAN PENGGUNAAN: menggunakan program sederhana seperti membuka file yang
     berisi struktur molekul. - Lihat lebih lanjut di: http://www.simulations-plus.com/Products.aspx?
     pID=13#sthash.JTLyDqHj.dpuf

4. PILIHAN OUTPUT: menyediakan berbagai saluran output untuk menyimpan, mentransfer, atau
    memvisualisasikan hasilnya dengan cepat dan efisien. - Lihat lebih lanjut di:
    http://www.simulations-plus.com/Products.aspx?pID=13 # sthash.JTLyDqHj.dpuf

5. KEMAMPUAN BATCH: memiliki modus batch built-in dan dapat dijalankan sebagai komponen
    Pipeline Percontohan ™. - Lihat lebih lanjut di: http://www.simulations-plus.com/Products.aspx?
     pID=13 # sthash.JTLyDqHj.dpuf

6. Deskriptor NOVEL: fitur koleksi unik perkiraan cepat deskriptor kuantum mekanik kepadatan elektronik dan reaktivitas baik di tingkat atom dan molekul - hasil dari proyek penelitian yang didanai pemerintah federal 3 tahun. - Lihat lebih lanjut di: http://www.simulations-plus.com/Products.aspx?pID=13 # sthash.JTLyDqHj.dpuf



Apa Saja yang Diprediksi?

  • pKa (konstanta ionisasi; model multiprotik)
  • Permeabilitas efektif manusia di usus kosong
  • Permeabilitas MDCK
  • Permeabilitas korneal
  • Permeabilitas Kulit Manusia
  • Kelarutan
- Kelarutan asli (kelarutan dalam air murni)
- Asli pH pada kejenuhan dalam air murni
- Kelarutan intrinsik dalam air murni
- Faktor kelarutan Garam
- Kelarutan dalam air pada pH yang ditentukan pengguna
- Larut dalam cairan simulasi gastrointestinal: FaSSGF, FaSSIF, dan FeSSIF
  • Rasio supersaturasi
  • logP 
  • logD 
  • Koefisien partisi udara-air
  • Koefisien difusi dalam air
  • Volume Molal
  • Perembesan penghalang darah-otak (dua model: kualitatif dan kuantitatif sebagai logaritma dari koefisien partisi BBB).
  • Protein plasma manusia mengikat sebagai persen terikat
  • Volum distribusi manusia
  • Rasio konsentrasi darah ke plasma
  • Penghambatan OATP1B1 transporter hati pada manusia
  • Aktivitas model
- Penghambatan integrase HIV dimediasi perpindahan strand
- Penghambatan integrase HIV dimediasi 3 'pengolahan

Kelebihan dan Kekurangan Linux

Linux merupakan sistem operasi yang jarang  dipakai di Indonesia, karena kebanyakan orang Indonesia lebih suka menggunakan sistem operasi windows. Sebenarnya linux tak sesulit yang diperkirakan karena kita hanya perlu sedikit belajar dan membiasakan untuk menggunakan Linux. Linux mempunyai kelebihan dan kelemahan dibanding sistem operasi windows, diantaranya:
Kelebihan Linux:

  • Linux lebih aman dari serangan virus komputer
  • Open Source, yaitu anda bisa mengedit, mengcopy maupun mendistribusikan sesuai dengan kebutuhan kita.
  • Free Software, tidak seperti windows , sistem operasi ini gratis sehingga kita tidak perlu mengeluarkan uang untuk membeli licensinya.
  • Kemudahan untuk melakukan upgrade
  • Experience live, CD instalasi sistem operasi linux berisi sistem operasi linux yang bisa dijalankan tanpa harus diinstal terlebih dahulu, jadi kita bisa belajar atau menggunakan linux tanpa harus menginstal secara permanen pada komputer. kita bisa menggunakan dengan menjalankan live CD.
Kekurangan Linux:
  • Para pengguna banyak yang belum terbiasa menggunakan linux, sehingga harus belajar terlebih dahulu.
  • Dukungan vendor pada hardware tak sebaik pada windows
  • Dukungan Aplikasi pada linux tak sebaik pada windows
  • Proses instalasi lebih rumit dibandingkan dengan windows

QUICHEM-PYSIDE


Quichem-Pyside digunakan untuk menguraikan suatu rumus kimia dan persamaan dengan cara mudah. Pada materi persamaan reaksi kimia, anda diharapkan untuk dapat menyetarakan suatu reaksi kimia terlebih dahulu agar dapat melanjutkan proses penghitungan kimia yang berada didalamnya.. Quichem-pyside merupakan software sederhana yang mudah digunakan, aplikasi ini sengaja dirancang untuk membantu Anda menguraikan rumus kimia, tanpa harus menekan kombinasi tombol. Penggunaannya sangat sederhana, Anda hanya perlu memasukkan rumus kimia Anda ingin olah dan aplikasi akan menghasilkan persamaan yang sesuai, dalam mode teks biasa, tampilan LaTeX dan kode HTML, untuk membantu Anda menyertakan persamaan di website http://www.softpedia.com
Berikut ini adalah Tampilan dari aplikasi Quichem-Pyside




Anda Tinggal Mendownload Aplikasinya dan Menginstallnya..

Aplikasi ini cocok untuk materi sifat kimia unsur-unsur karena, di dalam sifat kimia terdapat reaksi-reaksi yang perlu untuk disetarakan. Misalkan reaksi logam Alkali tanah dengan air.

Selasa, 14 Januari 2014

LIBRE OFFICE MATH

Cara menginstal software ini ada di add/remove, ubuntu software center, synaptic package manager atau bisa memberikan command line pada terminal dengan cara menekan Ctrl+Alt+T (connect internet), kemudian ketikkan : sudo apt-get install libre office math. Tunggu instalasi sampai selesai, lalu buka di Application-->science.

Lembar kerja di bagian bawah adalah tempat Anda menuliskan formula atau rumus-rumus ilmiah, yang secara otomatis akan juga diduplikasikan di lembar kerja utama Anda di bagian atas.
Element dalam formula dibagi di dalam sembilan (9) kelompok, yaitu:

1. Kelompok Unary/Binary Operators: digunakan untuk penulisan operator hitung, seperti positif,
     negatif, perkalian silang, perkalian titik, pembagian, operasi logika, dan lain-lain.
2. Kelompok Relations: digunakan untuk penulisan hubungan relasi matematika, seperti lebih besar
    dari, kurang dari, lebih besar sama dengan dari, dan lain-lain.
3. Kelompok Set Operations: digunakan untuk penulisan operasi himpunan, seperti anggota dari,
    himpunan bagian, himpunan kosong, dan lain-lain.
4. Kelompok Functions: digunakan untuk penulisan fungsi matematika seperti eksponensial,
    logaritma, trigonometri, pangkat, akar, dan lain-lain.
5. Kelompok Operators: digunakan untuk penulisan fungsi matematika seperti limit, integral, notasi
     sigma, dan lain-lain.
6. Kelompok Attributes: digunakan untuk penulisan atribut-atribut ilmiah, seperti negasi, vektor, dan
     setting karakter.
7. Kelompok Brackets: digunakan untuk penulisan dalam format tanda kurung, kurung kurawal,
    kurung himpunan, maupun kurung matriks.
8. Kelompok Formats: digunakan untuk penulisan superscript, subscript, penulisan unsur kimia,
     penulisan urutan matriks, dan lain-lain.
9. Kelompok Others: digunakan untuk penulisan simbol-simbol ilmiah lainnya.

Selamat mencoba dan semoga bermanfaat ^^

CARA MEMASANG KIMUX DI LAPTOP/KOMPUTER

Untuk dapat menginstal KIMUX pada komputer/laptop anda, pastikan memiliki partisi kosong kurang lebih sebesar 8,6 GB. Kemudian ikuti langkah-langkah sebagai berikut:
    1.    Klik Ubuntu pada dekstop, pilih bahasa untuk aplikasi kimux.
    2.  Klik lanjutkan.
    3.  Matikan koneksi dengan internet seperti wifi atau sejenisnya agar mempercepat
         proses penginstalan.
    4.    Pada tampilan Jenis Instalasi, pilih manual. Klik lanjutkan. Dalam hal ini jangan sampai
         salah pilih karena kesalahan dalam pemilihan bisa berakibat fatal.
    5.   Siapkan partisi yang akan di tempati Kimux dengan cermat, karena jika salah
         menempatkan, maka data yang berada pada partisi tersebut secara otomatis akan
         hilang.
    6.    Jika partisi masih dalam ntfs, pilih ubah.
    7.  Pada kolom use as, pilih Ext 4. Centang format the partition. Kemudian klik OK.
         Pastikan pada kolom titik kait sudah ada tanda (/).
    8.    Pilih pasang sekarang pada perintahnya. Klik lanjut.             
    9.    Masukkan sandi kimux anda, kemudian klik lanjutkan.
   10.  Kimux siap untuk digunakan.